有用微生物を含む製品や環境等より、各種の選択培地を用いて微生物を分離する。特に乳酸菌、酵母を主たる対象として操作を行う。

代表的な微生物発酵である乳酸発酵とアルコール発酵の解析を行う。分離微生物が産生する乳酸量をHPLC（高速液体クロマトグラフィー）で分析する。また、産生エタノール量についても酵素法により分析する。また、代表的な分離微生物を光学顕微鏡により観察する。これらの結果を検討し、応用微生物学、特に発酵に関する理解も深める。